Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF1P30408 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF1P30408 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms