Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD1P28340 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD1P28340 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD1P28340 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD1P28340 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD1P28340 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms