Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2B1P20020 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms