Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD58P19256 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD58P19256 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD58P19256 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CD58P19256 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD58P19256 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD58P19256 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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