Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG2P13521 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG2P13521 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG2P13521 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG2P13521 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG2P13521 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms