Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP3P12645 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BMP3P12645 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP3P12645 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP3P12645 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP3P12645 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms