Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
U2AF1L5P0DN76 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms