Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRCP08575 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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