Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NGFRP08138 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NGFRP08138 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NGFRP08138 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NGFRP08138 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms