Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3BO75182 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms