Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNQ3O43525 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms