Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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