Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP23O00161 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms