Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E9PMD0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E9PMD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
E9PMD0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E9PMD0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E9PMD0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E9PMD0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PMD0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms