Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms