Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3BA8MYP8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms