Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMTNL1A8MU46 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms