Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH2D7A6NKC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms