Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms