Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms