Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A0U1RQF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms