Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms