Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms