Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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