Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P92-201ENST00000454107 476 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IMPA1P1-202ENST00000522318 332 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC092287.1-201ENST00000565782 463 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF559-ZNF177-205ENST00000602856 419 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FETUB-202ENST00000382134 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 APLF-202ENST00000394342 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP2P1-201ENST00000475212 503 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC005197.1-201ENST00000597769 683 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC073534.1-201ENST00000598671 1056 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC023983.2-201ENST00000608010 562 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms