Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CDH18Q13634 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms