Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD10P28358 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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