Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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