Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM71Q2Q1W2 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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