Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CCSER1-209ENST00000509176 5847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NWD1-204ENST00000524140 7641 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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