Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms