Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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