Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BX005195.1-201ENST00000618097 1198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms