Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms