Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ACTN2P35609 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms