Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
E2F1Q01094 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms