Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC139795.3-201ENST00000606358 541 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms