Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms