Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC087499.3-202ENST00000441215 1173 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
LMO3Q8TAP4 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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