Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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