Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN3Q9Y4C0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms