Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KNSTRNQ9Y448 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNSTRNQ9Y448 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms