Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBNO2Q9Y2G9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms