Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms