Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT7Q9UIV1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT7Q9UIV1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms