Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMGXB4Q9UGU5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms