Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KDM5BQ9UGL1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KDM5BQ9UGL1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KDM5BQ9UGL1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms