Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIP2Q9UDT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms