Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms