Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP5Q9NZZ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms